Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME4Q14997 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME4Q14997 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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