Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX2Q14781 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms