Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRP1BQ14684 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RRP1BQ14684 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RRP1BQ14684 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRP1BQ14684 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRP1BQ14684 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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