Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1CQ13936 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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