Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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