Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SP140Q13342 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP140Q13342 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP140Q13342 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SP140Q13342 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SP140Q13342 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SP140Q13342 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SP140Q13342 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP140Q13342 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP140Q13342 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP140Q13342 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP140Q13342 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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