Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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