Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTP4A2Q12974 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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