Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF4Q08170 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms