Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms