Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms