Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms