Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XPCQ01831 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XPCQ01831 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XPCQ01831 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms