Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDM2Q00987 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms