Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX3P78415 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX3P78415 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRX3P78415 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX3P78415 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX3P78415 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms