Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFM1P61960 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms