Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS3AP61247 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms