Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DAP3P51398 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms