Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms