Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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