Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNTAP49354 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms