Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCCP43146 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCCP43146 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCCP43146 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCCP43146 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCCP43146 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCCP43146 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCCP43146 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms