Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCAMP43121 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCAMP43121 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms