Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms