Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGB2P26583 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms