Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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