Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCEA1P23193 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCEA1P23193 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms