Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP1P11387 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP1P11387 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP1P11387 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TOP1P11387 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms