Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI3P10071 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI3P10071 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms