Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms