Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX4O95219 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX4O95219 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX4O95219 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms