Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms