Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms