Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms