Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGTAO43765 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGTAO43765 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGTAO43765 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms