Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF13O43567 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF13O43567 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF13O43567 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms