Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms