Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms