Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPATO15228 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPATO15228 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPATO15228 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms