Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1CO15160 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms