Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-2B6SEH9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms