Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms