Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms