Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRQQ9UMZ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRQQ9UMZ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms