Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF608Q9ULD9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF608Q9ULD9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms