Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRBP1Q9P2E9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms