Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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