Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRHQ9HD43 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRHQ9HD43 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms