Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms