Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCL11BQ9C0K0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms